More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1840 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  61.31 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.86 
 
 		 200 aa  234  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.92 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  52.58 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  51.03 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.5 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.94 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  40.82 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  41.36 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.8 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.61 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  38.22 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.74 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.22 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.22 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.31 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.37 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.99 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  40.21 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  40.21 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  38 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.66 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.98 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  32.49 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  34.65 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.49 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  34.54 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.08 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  27.6 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.65 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.12 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  32.08 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.08 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.12 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.12 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.08 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.98 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.44 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  31.84 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.12 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.41 
 
 		 212 aa  94.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.6 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  32.04 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.02 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.6 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.16 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.96 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.91 
 
 		 214 aa  91.3  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.6 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.84 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.18 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.79 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.56 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.08 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.08 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.56 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  33.5 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.04 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.15 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.47 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.21 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  35.42 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  31.35 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.41 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>