More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1373 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  68.34 
 
 		 200 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  61.31 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  58.25 
 
 		 202 aa  222  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  59.57 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.38 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.78 
 
 		 202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.28 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  53.37 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.04 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  49.74 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  47.69 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.21 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.87 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.83 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  47.69 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.18 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.18 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.67 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  44.1 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  44.1 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.82 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.5 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.62 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.84 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  32.84 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.83 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.74 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  31.34 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  32.14 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.81 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.34 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.81 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  32.84 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.99 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.81 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.12 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.05 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.27 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.81 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.9 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.16 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  33.33 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.32 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.82 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.32 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.35 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.23 
 
 		 212 aa  92.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.96 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  31.66 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.7 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.31 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.08 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.54 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.63 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  32.06 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.88 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  30.89 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.59 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.9 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>