More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3095 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
200 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  54.87 
 
 
200 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  53.3 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50 
 
 
200 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.51 
 
 
200 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  52.06 
 
 
202 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.73 
 
 
197 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.75 
 
 
201 aa  177  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.23 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.23 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  45.88 
 
 
194 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.19 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  43.37 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.37 
 
 
198 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  43.37 
 
 
198 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.35 
 
 
198 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  42.86 
 
 
198 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.35 
 
 
198 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.35 
 
 
198 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.35 
 
 
198 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  41.75 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  41.75 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.01 
 
 
206 aa  141  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.56 
 
 
210 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.81 
 
 
231 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.68 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  28.65 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.41 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.07 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.79 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.32 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.57 
 
 
213 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.8 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.41 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.89 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
202 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 
211 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.05 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.69 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  30.32 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.96 
 
 
212 aa  87.8  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.02 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.28 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  31.02 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.64 
 
 
217 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.12 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.12 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.58 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.58 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.14 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.8 
 
 
214 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.35 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.58 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.79 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.65 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  29.65 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.28 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  28.28 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  29.65 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.34 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.64 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
205 aa  84.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.88 
 
 
210 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.63 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>