More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4409 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  97.47 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  94.95 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  87.88 
 
 		 198 aa  349  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  87.88 
 
 		 198 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  86.87 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.32 
 
 		 198 aa  347  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  81.82 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  77.16 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  77.16 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  50.53 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.21 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.33 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.08 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.39 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.88 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  46.6 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.94 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.8 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.86 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.29 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.37 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.31 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.3 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.14 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.18 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.27 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.84 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.85 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.41 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.94 
 
 		 213 aa  97.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.5 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  29.84 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.15 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  31.66 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.15 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30.2 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.41 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.41 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  30.5 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 		 228 aa  95.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.54 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  30.26 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  30.65 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.31 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.15 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.27 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  28.93 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.72 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.4 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  31.19 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.72 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.72 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.54 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.54 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.54 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  28 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.26 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.54 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.21 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  28.72 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.3 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.53 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.21 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.08 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.29 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.92 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.8 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>