More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5577 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  77.16 
 
 		 198 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  76.65 
 
 		 198 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  79.19 
 
 		 198 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  79.38 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  78.68 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  76.65 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  78.68 
 
 		 198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  78.46 
 
 		 198 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  50.78 
 
 		 194 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  47.42 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.1 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.81 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.44 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.15 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.13 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.21 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.28 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.88 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.34 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.8 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.32 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.47 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.99 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.02 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.81 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.59 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.85 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  32.62 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.21 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.7 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.1 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.22 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  28.28 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.55 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  28.86 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.85 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.83 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.22 
 
 		 217 aa  88.6  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.55 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.63 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  28.06 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.63 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.06 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  34.12 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.1 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.85 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.19 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.7 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.39 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  28.64 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.88 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.27 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.1 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.64 
 
 		 210 aa  84.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  31.37 
 
 		 206 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  27.37 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  28.64 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.72 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.96 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.71 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>