More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1463 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 
200 aa  373  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.04 
 
 
200 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  46.11 
 
 
194 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  43.94 
 
 
198 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.59 
 
 
202 aa  168  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.08 
 
 
202 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.94 
 
 
198 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  42.93 
 
 
198 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  45.23 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.46 
 
 
201 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.42 
 
 
198 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.22 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  41.45 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.22 
 
 
198 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.82 
 
 
200 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.22 
 
 
198 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.3 
 
 
202 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.43 
 
 
197 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  44 
 
 
197 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  44 
 
 
197 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.19 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.31 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.1 
 
 
210 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.34 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.31 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.29 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.11 
 
 
242 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.86 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  30.26 
 
 
217 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.32 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.83 
 
 
229 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.9732  normal  0.188603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  32.83 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.29 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  31.96 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  26.77 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  26.77 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.22 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.22 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  26.02 
 
 
219 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.85 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.06 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.95 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.5 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  27.36 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  31 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.19 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.52 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.04 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  27.45 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.48 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  27.45 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  27.45 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.13 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  27.45 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.14 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  29.35 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.52 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.91 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.52 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.52 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.29 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.15 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  28.64 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.99 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.1 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.99 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.59 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  27.96 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.38 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  30.61 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.32 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.67 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  27.86 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>