More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2947 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  56.92 
 
 		 200 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.38 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.31 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  50.77 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  52.31 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.48 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  49.48 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.98 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.69 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.72 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.82 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.43 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  40.31 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  39.29 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.29 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  39.29 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.29 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.27 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.78 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.74 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  38.34 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  38.34 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  30.69 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  31.84 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  32.34 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.61 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.68 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.86 
 
 		 231 aa  95.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.5 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.35 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.71 
 
 		 217 aa  91.3  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.93 
 
 		 214 aa  91.3  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.25 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.25 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.34 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.41 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  30 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.11 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1719  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.5 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.5 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  31.03 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.31 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.98 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.67 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  31.68 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.69 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 235 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.85 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  31.88 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.39 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.94 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.09 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.55 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.93 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.64 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.08 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  31.41 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>