More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0128 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  78.64 
 
 
222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  63 
 
 
207 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52 
 
 
199 aa  204  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.04 
 
 
196 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.49 
 
 
200 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  43.01 
 
 
194 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.56 
 
 
218 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.56 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.56 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.05 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.56 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.56 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  41.03 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  41.67 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  42.63 
 
 
197 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.84 
 
 
197 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.03 
 
 
197 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.03 
 
 
197 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.86 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  38.62 
 
 
197 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.03 
 
 
199 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.45 
 
 
197 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.86 
 
 
201 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  37.57 
 
 
197 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.31 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.58 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  39.15 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  39.15 
 
 
197 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.49 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  43.85 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  38.83 
 
 
197 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  38.83 
 
 
194 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  38.83 
 
 
197 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.04 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.9 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  39.9 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.9 
 
 
200 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.93 
 
 
202 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.13 
 
 
212 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 
201 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.09 
 
 
201 aa  124  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.9 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.9 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.9 
 
 
200 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.38 
 
 
200 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  38.34 
 
 
200 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.98 
 
 
200 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  38.25 
 
 
198 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.14 
 
 
200 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  36.84 
 
 
197 aa  121  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  36.84 
 
 
197 aa  121  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.25 
 
 
198 aa  121  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.7 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  36.81 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.38 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 
200 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 
196 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.96 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  40.1 
 
 
194 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  32.52 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.47 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.34 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.85 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.87 
 
 
206 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  34.87 
 
 
206 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.46 
 
 
214 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0241  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.425309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  28.23 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.85 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.93 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.37 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>