More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1677 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1677  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  41.76 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  38.17 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  38.38 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  39.11 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  38.89 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  37.78 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  32.42 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  35.88 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  37.35 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  35.96 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  35.16 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  31.22 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  29.63 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  29.28 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  30.98 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  34.32 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  30.99 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  30.94 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  30.85 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  33.92 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  29.35 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  31.76 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  30.59 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  30.59 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  33.15 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  32.18 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  32.24 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  29.26 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  30.77 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  30.27 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  28.19 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  30.65 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  28.72 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  28.72 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  31.46 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  28.19 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  30.18 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  29.59 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  28.19 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  28.34 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  28.72 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  29.41 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  26.06 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  26.88 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  27.66 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  27.66 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  29.47 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  27.66 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  27.66 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  29.24 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  28.19 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  31.01 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  34.46 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  27.13 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  27.66 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  28.65 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  30.54 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  27.66 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  29.75 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  29.78 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  31.46 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  27.49 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  29.34 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  29.75 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  28.8 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  29.75 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  27.27 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  27.81 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  30.9 
 
 		 167 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  27.81 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  28.65 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  29.75 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  27.13 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  28.65 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  28.48 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  28.74 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  26.63 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  28.48 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  29.21 
 
 		 168 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  28.05 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  29.65 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  31.14 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  28.48 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  26.92 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  27.27 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  31.21 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  28.92 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  29.21 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>