26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0676 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
345 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  45.37 
 
 
325 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  37.77 
 
 
540 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  43.07 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  36.32 
 
 
786 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  35.6 
 
 
257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  37.34 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  39.52 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  36.23 
 
 
254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
247 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  32.92 
 
 
254 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  31.4 
 
 
255 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  37.75 
 
 
281 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  32.84 
 
 
259 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  32.9 
 
 
595 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  36.31 
 
 
629 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  31.5 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  37.95 
 
 
482 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  33.54 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  30.34 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  35.95 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  35.53 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 
628 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.84 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  34.97 
 
 
478 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>