49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0675 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0675  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 464 aa  957    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.682908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  25.55 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1554  hypothetical protein  34.09 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.44 
 
 		 832 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 878 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.37 
 
 		 2240 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 767 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.02 
 
 		 810 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 617 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  22.37 
 
 		 593 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.67 
 
 		 579 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  22.96 
 
 		 420 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  22.96 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.41 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  22.96 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  22.96 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 2596 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  22.94 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  22.66 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  22.96 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.83 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  21.9 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 828 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.77 
 
 		 1022 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.59 
 
 		 1737 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.5 
 
 		 576 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.2 
 
 		 569 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 3145 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  20.29 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  33.71 
 
 		 632 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 174 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 673 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 605 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 4095 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 900 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 762 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.32 
 
 		 887 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1138 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>