84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0657 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0657  Methyltransferase type 11  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  35.9 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.06 
 
 
325 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.08 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
310 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  24.67 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  25.99 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 
270 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  26.32 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
204 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
310 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
328 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
328 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
328 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  32.63 
 
 
327 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
331 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  27.33 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
341 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
332 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 
265 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  24.74 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  26.77 
 
 
399 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  24.5 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.56 
 
 
263 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  27.56 
 
 
395 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  23.86 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  24.23 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  24.5 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  24.23 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  24 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.68 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.69 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  23.86 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  24.23 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0634  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00503727  hitchhiker  0.0000898788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  24 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  24.23 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.3 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1777  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.92 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  26.5 
 
 
342 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  23.66 
 
 
400 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  33.72 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  25.86 
 
 
287 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
331 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
275 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
196 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
274 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
168 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
248 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
248 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
226 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
249 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  29.07 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  24.74 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
324 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>