More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3604 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 512 aa  989    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  50.49 
 
 		 513 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  49.9 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  48.46 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  48.95 
 
 		 529 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  49.9 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  49.71 
 
 		 513 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  47.49 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  47.67 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  49.03 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  48.2 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  48.76 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  48.75 
 
 		 543 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  48.07 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  45.91 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  48.07 
 
 		 528 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  49.71 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  48.22 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  47.02 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  44.05 
 
 		 522 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  45.96 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  49.66 
 
 		 510 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  44.84 
 
 		 529 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  44.39 
 
 		 522 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  46.65 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  46.42 
 
 		 509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  44.01 
 
 		 508 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  41 
 
 		 521 aa  323  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  44.2 
 
 		 509 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  44.84 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  41.98 
 
 		 523 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  44.37 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  42.37 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  42.37 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  40.32 
 
 		 530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  40 
 
 		 516 aa  309  8e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  45.04 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  39.76 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  43.89 
 
 		 534 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  38.2 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  43.19 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  46.78 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  37.83 
 
 		 523 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  37.61 
 
 		 523 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  40.48 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  40.71 
 
 		 522 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  46.36 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  45.62 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  39.79 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  44.06 
 
 		 519 aa  293  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  38.6 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  42.96 
 
 		 509 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  290  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  48.1 
 
 		 509 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  39.64 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  39.64 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  35.81 
 
 		 512 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  41.22 
 
 		 498 aa  286  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.27 
 
 		 512 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  37.24 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  37.24 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  37.24 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  37.24 
 
 		 511 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  37.12 
 
 		 523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  37.53 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  37.1 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  37.16 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  37.72 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  38.81 
 
 		 513 aa  282  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  39.77 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  38.91 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  36.68 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  34.97 
 
 		 511 aa  280  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  36.75 
 
 		 519 aa  280  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  38.42 
 
 		 511 aa  279  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  37 
 
 		 519 aa  279  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  34.97 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  35.87 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  38.85 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  35.38 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  47.39 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  34.8 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  36.94 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  36.29 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  36.79 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  38.41 
 
 		 519 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>