More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3031 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  60.71 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  59.68 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  58.5 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  59.76 
 
 		 280 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  59.09 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  59.09 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  56.3 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  56.86 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  58.26 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  57.79 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  57.25 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  57.25 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  55.95 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  56.69 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  53.93 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  54.51 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  53.15 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  55.77 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  56.03 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  56.64 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  51.97 
 
 		 255 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  56.13 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  51.94 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  52.33 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  51.94 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  51.55 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  47.33 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  47.24 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  45.85 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  44.44 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  44.83 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 247 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.64 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.42 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.53 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.96 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 245 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 264 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.42 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 246 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  41.41 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  41.41 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  43.62 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  40.74 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.98 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.53 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>