More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2320 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  746    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.46 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.69 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  40.05 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  42.39 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.39 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  37.85 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  36.75 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.48 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.26 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  33.74 
 
 		 492 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  36.13 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  28.45 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  35.52 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  30.64 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  36.02 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  38.62 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  28.98 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  41.32 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  41.18 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  33.11 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  28.8 
 
 		 201 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.98 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  36.36 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  29.35 
 
 		 201 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  39.17 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  36.44 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  40.87 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.9 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  27.62 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.21 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  38.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  38.33 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  41.53 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  38.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.21 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  38.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  39.83 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  35.61 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.49 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.49 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  26.29 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  39.67 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  27.8 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  37.29 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>