210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2240 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 304 aa  634    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  71.19 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  65.8 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  66.45 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 303 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  69.44 
 
 		 295 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  69.62 
 
 		 295 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  65.15 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  69.44 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  67.47 
 
 		 303 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  65.41 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 299 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  67.13 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  62.87 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  62.54 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  64.14 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  64.71 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  63.27 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  61.89 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  63.01 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  66.32 
 
 		 299 aa  357  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  60.82 
 
 		 301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 300 aa  354  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  56.81 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  57.14 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  55.97 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  52.65 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  57.33 
 
 		 291 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  54.58 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  57 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  56.38 
 
 		 292 aa  318  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  56.86 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  53.63 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  53.72 
 
 		 300 aa  295  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  55.24 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  54.11 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  53.1 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  47.28 
 
 		 284 aa  278  7e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  45.73 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  52.6 
 
 		 286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  42.91 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  38.74 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.98 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 		 345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  42.3 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  41.29 
 
 		 323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  41.29 
 
 		 323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  46.83 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  38.77 
 
 		 348 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  38.26 
 
 		 348 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  43.94 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  40.83 
 
 		 323 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  42.59 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  42.59 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  41.01 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  41.78 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  39.87 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  44.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  41.26 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  40.61 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  40.62 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>