89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1452 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1452  asparagine synthase  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0528  asparagine synthase  96.14 
 
 
285 aa  557  1e-158  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0216136  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1537  asparagine synthase  41.24 
 
 
274 aa  177  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0538589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  29.64 
 
 
339 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.8 
 
 
536 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.77 
 
 
510 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.77 
 
 
510 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.77 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  30.53 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.77 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.77 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  23.33 
 
 
554 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  23.33 
 
 
554 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  23.33 
 
 
554 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  23.33 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  28.51 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.58 
 
 
510 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  23.33 
 
 
554 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.58 
 
 
510 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  26.81 
 
 
492 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  22.96 
 
 
554 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  28.34 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  25.54 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  24.1 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  22.92 
 
 
556 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.42 
 
 
554 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  23.61 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  23.83 
 
 
554 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  24.22 
 
 
554 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.22 
 
 
554 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 
514 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  27 
 
 
498 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  26.26 
 
 
554 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  23.85 
 
 
554 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  26.26 
 
 
554 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  26.26 
 
 
554 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  23.61 
 
 
554 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  22.98 
 
 
555 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.96 
 
 
530 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  26.43 
 
 
498 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  25.94 
 
 
484 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  29.55 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3544  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  31.85 
 
 
391 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0743711  normal  0.232019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  21.93 
 
 
554 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  24.79 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  21.77 
 
 
554 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  21.93 
 
 
554 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  21.93 
 
 
554 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  21.77 
 
 
554 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  22.37 
 
 
552 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  21.93 
 
 
554 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.39 
 
 
513 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  28.38 
 
 
334 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  28.05 
 
 
468 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  23.26 
 
 
554 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  26.18 
 
 
596 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.49 
 
 
488 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1466  asparagine synthase  25.22 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  21.37 
 
 
553 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  23.29 
 
 
556 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  22.56 
 
 
562 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  22.59 
 
 
555 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3073  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.3 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.48 
 
 
513 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  21.48 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  27.18 
 
 
563 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  27.18 
 
 
564 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  29.55 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  24.23 
 
 
499 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.46 
 
 
513 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  26.21 
 
 
563 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  26.21 
 
 
563 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1005  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.52 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32546  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
595 aa  43.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  21.77 
 
 
554 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  22.75 
 
 
482 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  21.77 
 
 
554 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>