31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3184 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 515 aa  1048    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  48.59 
 
 		 526 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  40.44 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  39.84 
 
 		 502 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  40.49 
 
 		 516 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  39.01 
 
 		 504 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  39.64 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  38.83 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  35.96 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  35.38 
 
 		 600 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  34.8 
 
 		 605 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  36.55 
 
 		 502 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  34.91 
 
 		 506 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  34.97 
 
 		 595 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  34.56 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  33.27 
 
 		 609 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  32.79 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  32.92 
 
 		 746 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.41 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.93 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.55 
 
 		 463 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2426  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.42 
 
 		 487 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.335348  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1683  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.99 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.01 
 
 		 491 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.07 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>