More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4207 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  100 
 
 		 377 aa  769    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  77.96 
 
 		 376 aa  584  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  70.56 
 
 		 383 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  61.99 
 
 		 378 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  59.63 
 
 		 377 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  52.79 
 
 		 379 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.29 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  38.74 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  39.27 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 402 aa  252  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  37.86 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 386 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.46 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 		 404 aa  242  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.2 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.12 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  36.18 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.44 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  38.17 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  37.06 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  37.77 
 
 		 386 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.27 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.21 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  36.8 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  37.87 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 400 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  36.51 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.62 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  39.48 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.87 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  37.43 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.68 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  36.73 
 
 		 395 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  37.23 
 
 		 386 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.65 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  34.83 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.04 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.27 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.11 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  35.84 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.89 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  38.64 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  35.35 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  36.7 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  36.7 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.67 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.66 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.5 
 
 		 427 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.62 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  34.18 
 
 		 423 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.32 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  38.87 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.78 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.68 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.34 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.17 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  35.97 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.9 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.65 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  38.48 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.8 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.08 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.39 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  36.61 
 
 		 375 aa  222  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.85 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  37.66 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.81 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.69 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.97 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  38.15 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  36.19 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.3 
 
 		 403 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  38.77 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  37.01 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 426 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  36.34 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>