238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3712 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
551 aa  1149    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4040  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  54.39 
 
 
546 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0316878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  52.01 
 
 
552 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  50.36 
 
 
551 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  49.45 
 
 
547 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  47.81 
 
 
551 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  46.21 
 
 
582 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4900  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  43.78 
 
 
558 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.21 
 
 
957 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  39.42 
 
 
545 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.5 
 
 
573 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.68 
 
 
609 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.11 
 
 
673 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  27.62 
 
 
446 aa  153  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 
470 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.83 
 
 
499 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.13 
 
 
471 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.51 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.2 
 
 
687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.08 
 
 
834 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  26.65 
 
 
485 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.38 
 
 
493 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.11 
 
 
460 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
503 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.56 
 
 
442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.56 
 
 
442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.14 
 
 
485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.11 
 
 
442 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.03 
 
 
551 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.99 
 
 
458 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.72 
 
 
456 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.52 
 
 
865 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.17 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  24.61 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.13 
 
 
536 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.68 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
442 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.65 
 
 
516 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27 
 
 
857 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27 
 
 
857 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 
488 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.15 
 
 
473 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.44 
 
 
403 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  25.17 
 
 
429 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.33 
 
 
448 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
860 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.83 
 
 
492 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.78 
 
 
455 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
858 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  25.38 
 
 
480 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.08 
 
 
538 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.1 
 
 
866 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  23.3 
 
 
438 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.84 
 
 
845 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  22.88 
 
 
446 aa  97.8  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.59 
 
 
822 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.2 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.1 
 
 
865 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.42 
 
 
824 aa  91.7  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.83 
 
 
768 aa  90.9  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
823 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.87 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.8 
 
 
822 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.36 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.66 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.27 
 
 
863 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.75 
 
 
846 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.06 
 
 
905 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.74 
 
 
835 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.57 
 
 
823 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  24.01 
 
 
827 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.48 
 
 
854 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.52 
 
 
689 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.45 
 
 
683 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.41 
 
 
696 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.02 
 
 
738 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.02 
 
 
738 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  22.97 
 
 
877 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  22.97 
 
 
877 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  22.97 
 
 
877 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  24.38 
 
 
877 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  24.38 
 
 
877 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.46 
 
 
859 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  23.55 
 
 
877 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  24.38 
 
 
918 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  22.73 
 
 
877 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.56 
 
 
688 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  25.86 
 
 
877 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  24.12 
 
 
844 aa  67.4  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  28.08 
 
 
854 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.36 
 
 
933 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
932 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.26 
 
 
698 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  24.24 
 
 
844 aa  64.7  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00411  putative aminopeptidase transmembrane protein  23.99 
 
 
748 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  22 
 
 
906 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.36 
 
 
932 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 
617 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>