100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3105 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  66.67 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  58.6 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  55.56 
 
 		 220 aa  246  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  53.7 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  53.7 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  49.32 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  50.47 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  47.73 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  49.77 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  43.89 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  43.84 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  37.39 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  36.82 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  35.03 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  30.49 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  31.07 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.75 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  26.64 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  31.25 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  31.85 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  25.82 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  28.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05841  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.81 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.29 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  29.47 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  29.47 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  29.47 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  28.78 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2265  hypothetical protein  25.33 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  30.46 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  25.46 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.65 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.97 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.54 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  30.51 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  29.94 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  29.03 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  29.03 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  26.62 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  26.62 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  26.62 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  26.87 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  28.41 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  26.87 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  27.47 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  24.74 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  24.11 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  25.87 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  27.84 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  25.87 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  23.2 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.3 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.87 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  28.03 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  27.59 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.28 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  20.88 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.182694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  23.72 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  24.42 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.895981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  25.82 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  23.41 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57883  predicted protein  28.24 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0900155  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  25 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.32 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.32 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3719  domain of unknown function DUF1731  28.21 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.86 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  28.21 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>