104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1673 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  61.09 
 
 		 233 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  59.36 
 
 		 219 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  55.71 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  52.51 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  49.32 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  50.46 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  44.95 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  46.15 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  44.75 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  46.33 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  44.84 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  37.56 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  34.07 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.35 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  32.86 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  31.16 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  30.91 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  32.47 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  27.83 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  33.76 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  25.44 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.04 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  29.57 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  26.91 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  27.49 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  29.05 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.44 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.49 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  30.52 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  30.32 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  29.82 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  31.17 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  29.86 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  29.86 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  33.11 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  31.43 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  29.22 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  30.97 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.19 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  26.04 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  30.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  33.09 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  29.52 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  29.88 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.76 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  29.24 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  31.82 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  23.88 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2265  hypothetical protein  27.35 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  23.5 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.34 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  25.82 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.37 
 
 		 165 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  28.29 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.56 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.56 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.06 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  29.06 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  22.22 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.06 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.86 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  28.75 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57883  predicted protein  25 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0900155  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43918  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  23.38 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.91 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  26.2 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.182694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.91 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>