147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1130 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  56.52 
 
 		 235 aa  257  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.29 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  37.96 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  39.61 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  37.96 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  39.61 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  35.41 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.88 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  37.8 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.41 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.65 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  38.95 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.3 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  38.5 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  35.65 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  38.91 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  36.18 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  37.98 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  34.4 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  35.86 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  34.56 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  34.91 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  40.58 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  40.58 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  36.02 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  34.78 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  35.59 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  35.68 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  35.07 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  34.11 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  32.27 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.98 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  37.19 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  33.8 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  37.08 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.71 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  37.65 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  33.86 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  36.97 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  32.37 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.4 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  36.67 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  34.71 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  34.71 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  35.76 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  37.65 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.71 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  35.76 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  35.76 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  37.22 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43918  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  30.45 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.54 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  37.57 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.23 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  34.15 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.55 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  35.71 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  32.55 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  33.84 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  31.71 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00870  endoplasmic reticulum protein, putative  35.84 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0031  hypothetical protein  34.72 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.65 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.73 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  34.3 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>