85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4143 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  471  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  63.01 
 
 		 220 aa  292  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  59.82 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  54.38 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  52.36 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  50.47 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  46.3 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  48.15 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  45.37 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  46.33 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  45.33 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  43.69 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  36.99 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  30.8 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  29.86 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  28.65 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  29.45 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.37 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  27.43 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  25.28 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  28.29 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  27.07 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  28.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  28.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  29.87 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05841  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  28.99 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  31.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  25.14 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  31.17 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  26.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  26.67 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  30.52 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.17 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  27.1 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  25.94 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.87 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.38 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  22.33 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  27.92 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  27.92 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.57 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  25.79 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  25.34 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  27.5 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  28.29 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  26.88 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  25.45 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.47 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  26.2 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  25.45 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  27.1 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2265  hypothetical protein  25.25 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.27 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.77 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  25.45 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.08 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  26.97 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  24.78 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  22.12 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  28.06 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.182694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  23.85 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  24.54 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.64 
 
 		 226 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  23.23 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>