45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2205 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  60.64 
 
 		 647 aa  813    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  100 
 
 		 656 aa  1353    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  67.12 
 
 		 663 aa  880    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  66.31 
 
 		 669 aa  916    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  51.5 
 
 		 722 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  43.9 
 
 		 673 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  44.97 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  36.17 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  33.21 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  34.26 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.9 
 
 		 491 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  50 
 
 		 129 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1010 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  24.38 
 
 		 920 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  49.41 
 
 		 180 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  40.8 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.79 
 
 		 377 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  31.68 
 
 		 118 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  22.48 
 
 		 1151 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 		 430 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  33.77 
 
 		 104 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.95 
 
 		 424 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  22.73 
 
 		 941 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  35.29 
 
 		 909 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  35 
 
 		 102 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  35.37 
 
 		 218 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.5 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  37.04 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  36.25 
 
 		 106 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  33.77 
 
 		 1142 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  22.81 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 115 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  32.56 
 
 		 918 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 101 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 101 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  27.84 
 
 		 430 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 105 aa  44.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  28.24 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.07 
 
 		 1138 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>