34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3610 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  51.85 
 
 		 669 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  49.49 
 
 		 129 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 656 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  55.7 
 
 		 647 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  51.9 
 
 		 663 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  51.35 
 
 		 457 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  40.96 
 
 		 106 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 106 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 106 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 108 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  25.3 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  26.58 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  31.9 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  31.58 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  31.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  31.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 344 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  32.1 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 355 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  35.44 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 348 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 102 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  31.08 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2197  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 106 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.353162  hitchhiker  0.00157135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 116 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>