262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1519 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  51.82 
 
 
275 aa  285  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
274 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
273 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  32.6 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.1 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  40.13 
 
 
267 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  26.05 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1505  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194787  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  29.84 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  34.95 
 
 
109 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.85 
 
 
252 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  37.76 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.53 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.92 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.53 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.86 
 
 
258 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.93 
 
 
250 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.53 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
290 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  29.46 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.81 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.38 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.54 
 
 
575 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
348 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.93 
 
 
234 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.08 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
457 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
235 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.49 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  23.24 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.43 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.49 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.49 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  24.03 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  24.75 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  29.13 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0374  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 
243 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  27.72 
 
 
263 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.67 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  23.44 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.7 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.81 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  24.22 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  20.13 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
198 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.45 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  29.76 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.09 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.46 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  30.1 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  30.69 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  30.63 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.17 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.73 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  30.69 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.17 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>