201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2836 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 509 aa  1025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  27.65 
 
 		 553 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 585 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  26.48 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  28.4 
 
 		 575 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 613 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 477 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 553 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  25.07 
 
 		 559 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  26.64 
 
 		 528 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  25.38 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  29.26 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.35 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  30.51 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.94 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  27.92 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.54 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.69 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  26.01 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.59 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  24.41 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.4 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.77 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.41 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.18 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.23 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 558 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.88 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.96 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  27.88 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.03 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  26.03 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.03 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.81 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.05 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3582  glycosyl transferase family 39  26.81 
 
 		 573 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  24.66 
 
 		 519 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  23.34 
 
 		 540 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  26.03 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.98 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  25.22 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  30.03 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  28.16 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.95 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.75 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.75 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.89 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.89 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.3 
 
 		 612 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.1 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  25.91 
 
 		 611 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  25.78 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  25.85 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.07 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.7 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.32 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.29 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  25.39 
 
 		 515 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  22.64 
 
 		 600 aa  67  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 		 622 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 510 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 		 622 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.52 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  25.15 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.82 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>