40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2759 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  70.17 
 
 		 187 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  67.96 
 
 		 199 aa  257  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  62.43 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  60.11 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  57.22 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  60.95 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  60 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  52.51 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  51.98 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
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NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  52.33 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  48.47 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  29.1 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  32.6 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
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NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
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NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
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NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
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NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
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NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0004  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.41 
 
 		 349 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00308372  normal  0.212879 
 
 
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NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 185 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
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NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  33.86 
 
 		 241 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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