More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2671 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  79.74 
 
 		 232 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  79.74 
 
 		 232 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  79.31 
 
 		 232 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  78.45 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  75 
 
 		 238 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  71.98 
 
 		 232 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  71.55 
 
 		 232 aa  347  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  70.26 
 
 		 232 aa  337  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  68.1 
 
 		 232 aa  333  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  68.1 
 
 		 233 aa  332  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  67.67 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  68.97 
 
 		 232 aa  328  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  67.24 
 
 		 232 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  66.38 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  66.81 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  67.38 
 
 		 234 aa  322  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  66.81 
 
 		 232 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 		 233 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  66.67 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  63.48 
 
 		 232 aa  284  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  59.48 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  54.51 
 
 		 235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  54.51 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  49.78 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  45.02 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  46.32 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  45.02 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  47.84 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  48.7 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  47.62 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  47.41 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  45.89 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  47.41 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  46.98 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  45.02 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  45.02 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  44.59 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  44.16 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  40.87 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  47.19 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  45.45 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  46.12 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  46.32 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  46.81 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  45.45 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  42.31 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  45.69 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  45.02 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  44.59 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  45.26 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  45.89 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  45.26 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  46.12 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  45.26 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  45.45 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  46.55 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  45.02 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  43.78 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  43.1 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  43.1 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  44.83 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  45.05 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  44.4 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  41.99 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  43.72 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  41.99 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  44.64 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  44.59 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  43.3 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  43.29 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  43.75 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  43.78 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  43.78 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  43.78 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  43.29 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  42.86 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  41.99 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  41.99 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  41.99 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  42.86 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  42.42 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  41.99 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>