51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2440 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  91.54 
 
 
130 aa  216  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  82.17 
 
 
128 aa  209  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  75.19 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  74.05 
 
 
131 aa  191  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  183  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  52.31 
 
 
129 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  47.06 
 
 
136 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  40.91 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  44.35 
 
 
119 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  34.69 
 
 
180 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  40.91 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  37.61 
 
 
556 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  33.64 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  35.23 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  36.27 
 
 
464 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  38.2 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  35.85 
 
 
373 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  34.02 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  34.69 
 
 
430 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  27.83 
 
 
1461 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  29.41 
 
 
214 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  30.84 
 
 
1227 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  31.25 
 
 
485 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  32.18 
 
 
222 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  36.56 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  28.3 
 
 
328 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>