58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0171 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  258  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  67.39 
 
 
144 aa  201  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  67.39 
 
 
153 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  67.63 
 
 
141 aa  190  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  66.19 
 
 
141 aa  186  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  60.43 
 
 
142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  60.43 
 
 
142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  60.43 
 
 
142 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  60.43 
 
 
142 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  58.27 
 
 
146 aa  183  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  60.43 
 
 
142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  62.02 
 
 
129 aa  173  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  63.04 
 
 
141 aa  173  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  53.96 
 
 
139 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  62.93 
 
 
122 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  31.47 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  31.85 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  34.97 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  31.51 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  33.56 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  27.94 
 
 
1123 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  33.96 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  28.36 
 
 
386 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  28.57 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  30.34 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  26.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  26.76 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.89 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  28.77 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  32.89 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  32.08 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  32.89 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  29.89 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.74 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  28.19 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  31.58 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.56 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  35.71 
 
 
130 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.56 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  39.24 
 
 
393 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  30.26 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  27.46 
 
 
138 aa  40.8  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  36.36 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  35.62 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  31.4 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>