More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3809 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.92 
 
 		 333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.61 
 
 		 333 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.26 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.65 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.26 
 
 		 334 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.46 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.91 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.46 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.46 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.48 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.13 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.48 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.5 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.84 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 		 350 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.44 
 
 		 329 aa  356  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.79 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.86 
 
 		 352 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.84 
 
 		 345 aa  355  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.84 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  58.31 
 
 		 353 aa  355  5.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.5 
 
 		 350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 		 378 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.86 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.54 
 
 		 347 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.68 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.03 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.03 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.03 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.68 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.17 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.08 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.49 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.06 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3908  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 340 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 343 aa  341  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.05 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.99 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3756  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  338  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 		 337 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296629  normal  0.374083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.81 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 		 334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  56.35 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1051  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.53 
 
 		 349 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00488786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.77 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 335 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.57 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.57 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.19 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1837  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.57 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.57 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 338 aa  331  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 362 aa  331  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 336 aa  331  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.19 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.19 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  54.87 
 
 		 338 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.87 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 340 aa  330  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0169  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.48 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 331 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 362 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 		 335 aa  329  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.05 
 
 		 334 aa  329  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  55.48 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.75 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 362 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>