More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1837 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1837  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 336 aa  680    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  68.29 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  63.64 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.17 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.11 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.31 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.82 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.82 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.69 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.21 
 
 		 351 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.61 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.4 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.79 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.09 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.09 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.24 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.24 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.24 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.24 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.19 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.24 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.39 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.42 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.31 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.93 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.09 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.02 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.6 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.02 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.02 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.56 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.63 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.42 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.05 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.06 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.63 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.63 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.56 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.45 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  57.96 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.01 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.09 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.4 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.67 
 
 		 329 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.52 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.21 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.57 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.27 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.97 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.04 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.04 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.71 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  58.46 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.89 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.73 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.43 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3998  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.57 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.9 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>