More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2652 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  62.11 
 
 
239 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  62.11 
 
 
238 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  58.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  62.62 
 
 
236 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  60.58 
 
 
242 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  53.88 
 
 
251 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
251 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  56.46 
 
 
234 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  57 
 
 
254 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  50.42 
 
 
248 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  47.33 
 
 
245 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
254 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  52.27 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  53.27 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  53.27 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 
260 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 
260 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
254 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  54.29 
 
 
283 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  53.81 
 
 
251 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  53.52 
 
 
255 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  47.51 
 
 
253 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  48.66 
 
 
262 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  53.27 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  46.59 
 
 
245 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  46.7 
 
 
246 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  45.5 
 
 
247 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  44.94 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  49.3 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  44.94 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  50.48 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  51.02 
 
 
222 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.54 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  46.06 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  44.02 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  46.55 
 
 
266 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 
247 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  48.76 
 
 
248 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  48.34 
 
 
289 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  46.12 
 
 
277 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 
248 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 
248 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 
248 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  42.8 
 
 
247 aa  192  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 
255 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  46.49 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  46.15 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  43.05 
 
 
252 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  46.49 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  46.49 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 
248 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 
222 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  47.06 
 
 
253 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
253 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  47.29 
 
 
244 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  43.03 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  47.29 
 
 
244 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  41.8 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  41.8 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  46.31 
 
 
256 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  41.8 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  41.8 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  47.29 
 
 
244 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  44.3 
 
 
247 aa  188  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  43.57 
 
 
246 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  43.57 
 
 
246 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 
299 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  45.26 
 
 
254 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  47.37 
 
 
289 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  43.23 
 
 
248 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  45.66 
 
 
249 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  45.66 
 
 
249 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
253 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
253 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  48.22 
 
 
251 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  47.72 
 
 
247 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  45.66 
 
 
249 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  45.37 
 
 
246 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
252 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  49.74 
 
 
238 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  47.29 
 
 
244 aa  185  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  40.98 
 
 
249 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  44.02 
 
 
264 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  41.32 
 
 
253 aa  185  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
245 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  44.3 
 
 
258 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  45.75 
 
 
293 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  45.28 
 
 
253 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  49.74 
 
 
262 aa  184  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  46.52 
 
 
251 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.28 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  39.92 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  49.06 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.28 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>