51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1381 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  44.3 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  42.24 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  42.24 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  48.32 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  41.98 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  32.53 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  33.1 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  34.03 
 
 		 166 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  32.64 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  31.94 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  32.37 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  31.25 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  30.91 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  32.41 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  32.41 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  31.25 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  33.1 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  31.25 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  33.1 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  30.56 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  30.5 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  25.83 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  29.08 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  29.08 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  27.27 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  29.49 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  28.17 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  29.07 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  23.08 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  23.08 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  23.08 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  25.9 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  26.52 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  27.27 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  63.04 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  26.56 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  28.12 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  26.97 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  27.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  23.75 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  23.44 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  23.12 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  23.48 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  25 
 
 		 175 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>