More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1017 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  65.7 
 
 		 742 aa  1010    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 733 aa  1513    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  41.3 
 
 		 754 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 681 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 		 714 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  36.52 
 
 		 719 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  35.95 
 
 		 789 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 724 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.79 
 
 		 719 aa  363  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  34.85 
 
 		 700 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  34.79 
 
 		 656 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  34.7 
 
 		 725 aa  353  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  33.97 
 
 		 745 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 726 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  34.43 
 
 		 768 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  35.34 
 
 		 655 aa  345  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  34.09 
 
 		 702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  32.76 
 
 		 668 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  35.08 
 
 		 717 aa  335  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  34.31 
 
 		 725 aa  334  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 648 aa  331  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 648 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  34.56 
 
 		 720 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 686 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  34.18 
 
 		 687 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 712 aa  330  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  33.64 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 706 aa  327  6e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  34.45 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  34.17 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.82 
 
 		 686 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  33.55 
 
 		 694 aa  324  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 687 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  34.43 
 
 		 708 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.34 
 
 		 732 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.06 
 
 		 751 aa  320  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.92 
 
 		 751 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 676 aa  319  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  32.62 
 
 		 710 aa  317  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  32.93 
 
 		 688 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  34.27 
 
 		 745 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.01 
 
 		 759 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.63 
 
 		 741 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.43 
 
 		 729 aa  313  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 689 aa  313  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.09 
 
 		 715 aa  313  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 747 aa  310  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 		 686 aa  310  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 742 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 		 711 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.62 
 
 		 753 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.52 
 
 		 755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.53 
 
 		 753 aa  308  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  33.52 
 
 		 753 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.52 
 
 		 751 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.52 
 
 		 751 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.19 
 
 		 735 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.5 
 
 		 833 aa  307  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  33.91 
 
 		 751 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.91 
 
 		 747 aa  306  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.91 
 
 		 751 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.52 
 
 		 747 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.12 
 
 		 785 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.58 
 
 		 707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 685 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  32.86 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  34.05 
 
 		 751 aa  303  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 716 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.72 
 
 		 838 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  32.9 
 
 		 741 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.63 
 
 		 765 aa  302  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 716 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.49 
 
 		 768 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 		 731 aa  300  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.82 
 
 		 858 aa  300  8e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.66 
 
 		 831 aa  300  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 625 aa  300  9e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.37 
 
 		 754 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.09 
 
 		 639 aa  298  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.97 
 
 		 781 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.8 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  32.27 
 
 		 757 aa  298  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.45 
 
 		 673 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.86 
 
 		 725 aa  297  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  31.58 
 
 		 639 aa  297  6e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.42 
 
 		 718 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.96 
 
 		 763 aa  296  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  34.1 
 
 		 759 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 724 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.04 
 
 		 694 aa  294  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.65 
 
 		 729 aa  294  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.79 
 
 		 742 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  32.24 
 
 		 706 aa  293  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  33.48 
 
 		 696 aa  293  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.47 
 
 		 794 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>