37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1645 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1645  hydrolase  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1452  hydrolase  52.55 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1578  hydrolase  50 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000487041 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  46.43 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.42 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.82 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.22 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.97 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  30.25 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.53 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.31 
 
 		 224 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 210 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 		 232 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 		 228 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.25 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 272 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 242 aa  41.2  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  23.75 
 
 		 266 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>