76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0689 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  78.38 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  70.73 
 
 		 163 aa  239  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  68.29 
 
 		 280 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  41.27 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  40.95 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  39.81 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  37.86 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 253 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  39.05 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  40.2 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  37.01 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  38.02 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  29.01 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  34.09 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  36.15 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  30.52 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  33.96 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  30.67 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  30.77 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  39.05 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  36.19 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  33.01 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  35.35 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  31.75 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  30.48 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  38.14 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  33.01 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  40.2 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  29.59 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 269 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  31.96 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 		 311 aa  48.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  28.23 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  28.23 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  52.17 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  34.34 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 		 294 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  34.43 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  33.73 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0065  methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  25.58 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  32.81 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  35.66 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  29.29 
 
 		 271 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.62 
 
 		 302 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 260 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 270 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  23.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  29 
 
 		 244 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.24 
 
 		 298 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 		 298 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 240 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 		 295 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 300 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 		 295 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 		 295 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  59.38 
 
 		 244 aa  40.8  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 		 300 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  45.24 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>