40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4110 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  822    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  49.24 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  44.64 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  45.5 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  35.12 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  26.81 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.43 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  26.45 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  26.46 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.35 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  27.42 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  26.49 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  26.49 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  26.49 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  23.22 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  27.02 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  24.61 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  22.92 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  26.11 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  24.31 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  22.9 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  25.79 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  23.22 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  25.77 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  25.77 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  23.63 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  27.32 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  24.7 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  23.2 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  23.34 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  28.37 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  22.01 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  23.6 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  21.52 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  22.52 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  23.44 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  29.41 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  24 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  27.59 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>