93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1825 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  100 
 
 		 509 aa  1067    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  50.1 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  43.53 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  46.61 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  43.49 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  44.31 
 
 		 572 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  45.01 
 
 		 535 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  43.55 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  44.51 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  43.79 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  43.79 
 
 		 623 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  43.58 
 
 		 607 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  43.58 
 
 		 564 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  48.47 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  44.31 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  44.31 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  43.58 
 
 		 564 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  43.5 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  41.39 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  41.47 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  44.81 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  42.6 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  42.6 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  43 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  42.8 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  43.72 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  41.27 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  41.27 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  41.27 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  44.29 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  41.27 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  41.27 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  42.6 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  43.53 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  44.33 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  44.53 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  43.67 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  42.3 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  43.29 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  41.26 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  42.04 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  41.98 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  42.71 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  43.2 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  43 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  43 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  43 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  43 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  43 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  43.41 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  39.22 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  41.5 
 
 		 588 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  34.35 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  32.48 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  33.26 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  29.22 
 
 		 593 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 495 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  34.22 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  34.22 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  31.79 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  35.52 
 
 		 529 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  30.5 
 
 		 811 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  27.56 
 
 		 751 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  27.66 
 
 		 621 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  28.35 
 
 		 875 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  26.81 
 
 		 691 aa  140  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 581 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  27.95 
 
 		 732 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.03 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  27.86 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  28.71 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  23.8 
 
 		 708 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.64 
 
 		 717 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  43.94 
 
 		 96 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25.37 
 
 		 423 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  22.48 
 
 		 790 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.27 
 
 		 676 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.95 
 
 		 778 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.95 
 
 		 778 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.95 
 
 		 778 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  23.78 
 
 		 896 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.31 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.23 
 
 		 736 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>