More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1408 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.23 
 
 		 601 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  57.36 
 
 		 601 aa  740    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  55.7 
 
 		 598 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2263  acyl-CoA dehydrogenase family protein  83.5 
 
 		 606 aa  1087    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.51 
 
 		 601 aa  767    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.49 
 
 		 595 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  58.4 
 
 		 601 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.01 
 
 		 599 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.52 
 
 		 598 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  58.07 
 
 		 601 aa  750    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0137  acyl-CoA dehydrogenase  60.39 
 
 		 606 aa  770    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.79 
 
 		 597 aa  717    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.23 
 
 		 601 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.66 
 
 		 595 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.9 
 
 		 601 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.36 
 
 		 598 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  60.07 
 
 		 601 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.57 
 
 		 601 aa  749    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.66 
 
 		 599 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4106  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.66 
 
 		 606 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.99 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.49 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.02 
 
 		 598 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.57 
 
 		 601 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.03 
 
 		 595 aa  744    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.66 
 
 		 595 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  51.49 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.97 
 
 		 597 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47600  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.82 
 
 		 606 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.91 
 
 		 603 aa  702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0148  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.74 
 
 		 606 aa  763    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.79 
 
 		 597 aa  717    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  55.63 
 
 		 599 aa  703    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 595 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.66 
 
 		 595 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3891  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.8 
 
 		 606 aa  776    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 606 aa  1268    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.96 
 
 		 600 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.36 
 
 		 601 aa  774    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.07 
 
 		 606 aa  773    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.55 
 
 		 598 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.73 
 
 		 601 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.49 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.49 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.4 
 
 		 595 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.49 
 
 		 595 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.16 
 
 		 595 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.16 
 
 		 597 aa  626  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.16 
 
 		 597 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.66 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  50.74 
 
 		 595 aa  621  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.99 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.5 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.5 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.25 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  50.08 
 
 		 596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  49.42 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  48.76 
 
 		 597 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.51 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.33 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.93 
 
 		 598 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.26 
 
 		 598 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  48.26 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 		 601 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.43 
 
 		 598 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.5 
 
 		 598 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.5 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.09 
 
 		 598 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.83 
 
 		 598 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.76 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.75 
 
 		 596 aa  588  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.01 
 
 		 595 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.65 
 
 		 597 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  47.83 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.91 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.82 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.11 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4476  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.95 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.84 
 
 		 597 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.84 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.19 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 		 592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.73 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.19 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.25 
 
 		 590 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3245  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.532993  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0737  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.41 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.01 
 
 		 596 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.5 
 
 		 596 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>