More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1682 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  97.22 
 
 		 144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  95.83 
 
 		 144 aa  270  5.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  95.14 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  78.47 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  68.75 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  56.92 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  57.14 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  52.31 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  57.02 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  50.34 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  57.02 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  52.34 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  47.69 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  45.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  45.04 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  51.28 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  44.53 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  46.15 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.44 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  49.59 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  46.15 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  44.44 
 
 		 132 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  46.09 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  41.74 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  45.13 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  43.66 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  43.48 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  44.55 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89472  predicted protein  41.35 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  37.4 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  41.46 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  39.52 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  42.16 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  43.14 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  39.66 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  42.73 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  39.84 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  40.65 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0216  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  40.32 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  39.84 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  37.4 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0293  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  37.1 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  40.87 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  40.83 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  36.59 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  37.1 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0671  50S ribosomal protein L14  36.67 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.608974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  40.65 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  38.71 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  40.87 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  41.82 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  39.09 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  39.64 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  39.09 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  39.02 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  40.65 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  40.32 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  39.62 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  36.29 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  38.46 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  38.71 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  34.48 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  36.67 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  35.43 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  36.36 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  41.13 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  41.13 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  37.7 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  41.13 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  36.59 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  36.36 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  37.1 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  38.26 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  39.34 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17301  50S ribosomal protein L14  34.68 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.38809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>