More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2913 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  217  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 		 122 aa  207  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  204  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  203  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  199  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  194  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  72.13 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3657  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1473  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0605  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23370  LSU ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000150198  hitchhiker  0.00000101977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>