More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0452 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  81.82 
 
 
132 aa  231  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  80.3 
 
 
132 aa  224  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  74.24 
 
 
132 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  75 
 
 
132 aa  208  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 
132 aa  176  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  59.09 
 
 
132 aa  175  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  60.61 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  164  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  158  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  54.55 
 
 
132 aa  152  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 
135 aa  148  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  54.2 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  140  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
132 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  44.2 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  54.7 
 
 
138 aa  130  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  48.67 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  42.02 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  44.63 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.38 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  47.79 
 
 
144 aa  110  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  45.22 
 
 
144 aa  110  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  44.35 
 
 
144 aa  110  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  43.65 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  44.35 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  43.48 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  42.06 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  40.62 
 
 
143 aa  105  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  46.15 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  46.15 
 
 
122 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  87  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 
122 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  83.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  83.6  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  83.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  83.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  42.74 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  46.22 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  41.74 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  42.61 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  45.38 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  43.7 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  43.7 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  45.38 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  39.34 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  41.18 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  45.05 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0499  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16681  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  40.34 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>