More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1128 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  246  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  215  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  215  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  176  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  70.25 
 
 
122 aa  174  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  173  9e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  173  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  169  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  65.29 
 
 
122 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  169  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  167  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  167  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  167  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  64.46 
 
 
122 aa  167  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  167  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  66.12 
 
 
122 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  66.94 
 
 
122 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  66.39 
 
 
122 aa  166  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  65.29 
 
 
122 aa  166  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  60.66 
 
 
122 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  64.46 
 
 
122 aa  165  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  66.12 
 
 
122 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  62.3 
 
 
122 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  65.29 
 
 
122 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  165  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  65.29 
 
 
122 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  164  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  64.46 
 
 
122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  65.29 
 
 
122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  163  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  163  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  63.93 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0805  50S ribosomal protein L14  60.33 
 
 
122 aa  161  3e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000675235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  65.29 
 
 
122 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0094  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  161  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.840193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  65.29 
 
 
122 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  160  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  63.11 
 
 
122 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>