More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0800 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  100 
 
 		 140 aa  282  8e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  55.65 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  56.45 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  53.91 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  54.03 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  53.23 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  54.03 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  48.84 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  48.06 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  51.72 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  50.34 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  49.66 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  46.81 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  50.34 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.71 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  47.45 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  45.71 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  46.97 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  52.89 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  49.56 
 
 		 138 aa  119  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  44 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  44.7 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  48.67 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  39.2 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  42.02 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  44.7 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  47.2 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  43.94 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  42.28 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  42.42 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  44.83 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  48 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  39.2 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  40.16 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  40.83 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  39.34 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  42.86 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  37.07 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  37.07 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  41.38 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17551  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17391  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1640  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89472  predicted protein  38.84 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf432  50S ribosomal protein L14  41.07 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17301  50S ribosomal protein L14  37.82 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.38809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  39.66 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  43.36 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3713  50S ribosomal protein L14  36.21 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  40.52 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  43.1 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  39.17 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06146  50S ribosomal protein L14 (AFU_orthologue; AFUA_2G08520)  34.38 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00443765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  40.52 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  42.2 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  38.52 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_002978  WD0671  50S ribosomal protein L14  37.5 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.608974  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16681  50S ribosomal protein L14  36.97 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  38.26 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  36.51 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  37.8 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  41.32 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  36.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  40.17 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0216  50S ribosomal protein L14  35.04 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  36.22 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  39.29 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  38.79 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  39.29 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  37.5 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  38.79 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  38.79 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0499  50S ribosomal protein L14  34.13 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1473  50S ribosomal protein L14  34.19 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120396  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1119  50S ribosomal protein L14  36.13 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0701  50S ribosomal protein L14  36.21 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000715462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  39.32 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  37.3 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19931  50S ribosomal protein L14  36.13 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  36.89 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  37.7 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  39.29 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  37.3 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  40.16 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  39.66 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  39.66 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  34.92 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  36.51 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  35.71 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  36.13 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  35.29 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  37.07 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  39.29 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  37.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  36.75 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  38.39 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>