More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1259 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  240  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  90.16 
 
 
122 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  83.74 
 
 
123 aa  204  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  200  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  197  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  81.97 
 
 
122 aa  198  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  196  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  196  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  196  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  197  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  196  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  193  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  193  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  192  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  192  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  192  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000182968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278183  unclonable  0.0000000000139083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000238487  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  191  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  190  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  80.67 
 
 
119 aa  190  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  190  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  78.99 
 
 
119 aa  189  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  189  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000251869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  189  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  78.99 
 
 
119 aa  189  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000141408  unclonable  0.0000000000497407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  188  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  187  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  187  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  185  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000168914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000280121  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  184  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  185  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  184  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  184  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  183  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  72.13 
 
 
122 aa  183  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  182  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  74.59 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0999  ribosomal protein L14  75.41 
 
 
121 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00274918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  75.61 
 
 
123 aa  181  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>