More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0091 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  266  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  76.52 
 
 
132 aa  219  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  72.73 
 
 
132 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  74.24 
 
 
132 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  70.45 
 
 
132 aa  205  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  64.39 
 
 
132 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 
132 aa  184  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  59.09 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  170  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  55.3 
 
 
132 aa  165  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  48.48 
 
 
135 aa  151  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  150  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 
132 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  48.09 
 
 
132 aa  141  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  48.09 
 
 
132 aa  140  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  45.8 
 
 
138 aa  135  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  48.09 
 
 
138 aa  135  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  40.71 
 
 
141 aa  120  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  39.2 
 
 
140 aa  117  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  42.06 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  42.02 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  42.02 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  41.18 
 
 
144 aa  111  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  40.34 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  39.67 
 
 
138 aa  110  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  46.09 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  37.69 
 
 
143 aa  108  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  39.34 
 
 
137 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  44.63 
 
 
122 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  44.63 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  41.6 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  87  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  87  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  42.4 
 
 
122 aa  87  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  40.8 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  40.16 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  40.16 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  85.9  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  41.6 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0499  50S ribosomal protein L14  41.6 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  40.8 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  40.8 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16681  50S ribosomal protein L14  40.8 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  41.32 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  41.32 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  43.8 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  42.5 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  38.02 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  42.4 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  39.2 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>