More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1784 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  97.22 
 
 		 144 aa  273  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  97.22 
 
 		 144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  96.53 
 
 		 144 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  79.86 
 
 		 144 aa  222  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  70.83 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  57.69 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  54.62 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  57.94 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  50.34 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  57.02 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  51.56 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  48.46 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  45.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  52.14 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  45.04 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  45.26 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  50.41 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.14 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  46.92 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  46.92 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  45.3 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  40.87 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  45.22 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  44.25 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  44.37 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  42.61 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  87  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89472  predicted protein  40.6 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  37.4 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  41.46 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  43.14 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0293  50S ribosomal protein L14  37.9 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  42.16 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  37.4 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  42.73 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  42.73 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  39.84 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  40.65 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  38.71 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  41.74 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  42.45 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  39.09 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  39.84 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  37.1 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  37.9 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0216  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0671  50S ribosomal protein L14  36.67 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.608974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  37.1 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  40.87 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  41.74 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  38.71 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  37.1 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  38.33 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  41.46 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  41.82 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  39.64 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  41.13 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  38.46 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  36.59 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  40.65 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  38.71 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  38.52 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  34.48 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  36.22 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  40.87 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  37.27 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  35.48 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  37.27 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  40.5 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  36.36 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  39.02 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0805  50S ribosomal protein L14  39.02 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000675235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  41.13 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  35.77 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>